Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms