Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms