Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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