Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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