Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGDRQ13258 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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