Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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