Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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