Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms