Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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