Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC8Q09428 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms