Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms