Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms