Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TFF3Q07654 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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