Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms