Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms