Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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