Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNRPNP63162 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms