Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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