Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP6P59044 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms