Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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