Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms