Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPHA4P54764 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPHA4P54764 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPHA4P54764 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPHA4P54764 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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EPHA4P54764 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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EPHA4P54764 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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EPHA4P54764 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA4P54764 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms