Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23BP54727 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms