Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RORCP51449 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RORCP51449 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RORCP51449 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RORCP51449 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RORCP51449 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RORCP51449 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RORCP51449 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RORCP51449 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RORCP51449 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RORCP51449 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RORCP51449 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RORCP51449 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RORCP51449 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RORCP51449 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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