Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms