Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP3P50461 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms