Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IQGAP1P46940 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQGAP1P46940 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms