Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF5P43026 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms