Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP2P42575 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP2P42575 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP2P42575 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASP2P42575 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASP2P42575 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP2P42575 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms