Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC19A1P41440 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms