Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDH1P40925 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDH1P40925 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDH1P40925 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDH1P40925 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDH1P40925 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms