Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms