Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LTBRP36941 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LTBRP36941 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms