Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms