Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKLRP30613 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKLRP30613 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms