Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms