Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PLNP26678 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PLNP26678 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PLNP26678 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms