Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms