Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDSP20132 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDSP20132 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDSP20132 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDSP20132 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDSP20132 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms