Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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