Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSP16219 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSP16219 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms