Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms