Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms