Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms