Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms