Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms