Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms