Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI2P10070 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI2P10070 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms