Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RD3LP0DJH9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms