Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHOP08100 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHOP08100 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHOP08100 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms